tsarin gudanar da kantin magani, wanda aka fi sani da tsarin bayanan kantin magani. Wadannan tsarin na iya zama fasaha mai zaman kanta don amfani da kantin magani kawai, ko kuma a cikin asibiti, ana iya haɗa kantin magani a cikin tsarin shigar da likitan kwamfuta na asibiti Ayyuka masu mahimmanci don tsarin sarrafa kantin magani na asali, mai aiki sun haɗa da mai amfani, shigar da bayanai da riƙewa, da iyakokin tsaro don kare bayanan marar lafiyar . Sau da yawa ana siyan software na kwamfuta na kantin magani a shirye-shiryen ko kuma mai sayar da miyagun ƙwayoyi ya ba da shi a matsayin wani ɓangare na hidimarsu. tsarin aiki na software na kantin magani daban-daban sun zama ruwan dare a duk hanyoyin aiki da yawa.